La Universidad de las Naciones reúne siete facultades: Ministerios Cristianos, Ciencias Humanas y Estudios Internacionales, Salud y Consejería, Comunicaciones, Ciencia y Tecnología, Artes y Educación. Es una Universidad de Educación modular, o sea, cada estudiante reúne créditos en diversos cursos con duración de 3 a 9 meses.

Cada uno de estos cursos esta dividido en periodos teórico y práctico, durante este el estudiante tiene la oportunidad de aplicar lo que aprendió a través del servicio cristiano. Este modelo es una opción para aquellos que desean no solo un título, pero un involucramiento inmediato y efectivo en el campo misionero.