La Universidad de las Naciones reune siete facultades: Ministerios Cristianos, Ciencias Humanas y Estudios Internacionales, Comunicaciones, Ciencia y Tecnología, Salud y Consejería, Artes y Educación. Es una Universidad de Educación modular, o sea, cada estudiante reune créditos en cursos con duración de 3 a 9 meses.

Cada uno de estos cursos esta dividido en periodos teórico y práctico en el cual el estudiante tiene la oportunidad de aplicar lo que aprendió en el servicio cristiano. Este modelo es una opción para aquellos que desean no solo un titulo, sino un involucramiento inmediato y efectivo con el campo misionero.